藥師佛的十二大願
如果你能夠規律地修習整套藥師佛法，將會獲得極大的利益，因為此法具有強大的加持力；即使你只能偶爾修法，也會因為和此法的接觸而獲益匪淺。正如阿彌陀佛與藥師佛的經典中所教導的，憶念與持誦藥師佛名號會有數不盡的利益，這些利益大多數與藥師佛在初發菩提心時所立下的十二大願有關，而這十二大願又都脫不開藥師佛的名號。因此，與藥師佛相關的利益，多半可由憶念與持誦他的名號而獲得。
在這次的說法大會中，最重要的弟子是文殊菩薩，事實上，佛陀這次說法是應他的要求講解所促成，其後成為後人所稱的《藥師佛經》。在經的開端，是文殊菩薩以特定的姿勢向佛陀提出請求。文殊菩薩屈左膝，而以右膝跪地，他的雙掌表示虔敬地合十置於胸前。文殊菩薩採用這樣的姿勢，因為那是佛陀的弟子向佛陀說話時一致採用的姿勢。
文殊菩薩以那樣的姿勢面對佛陀，對佛陀說話，請求他教導大家關於發殊勝誓願以利益眾生的諸佛---他們發的是什麼誓願，以及憶念他們的名號有何利益。他請求佛陀為利益未來的眾生而加以解說。
佛陀對於文殊菩薩發言的第一個回應是，讚嘆他提出此一請求。佛陀對文殊菩薩說：「你提出的這個問題極好，而且很適當，因為你發問的動機是慈悲，以及願望求得淨化一般污染的法門，特別是針對未來的眾生消除疾病的法門。」
佛陀說：「文殊師利，你因此要聽好，完整聆聽，並要記在心中。」之後，佛陀告訴文殊師利，在東方無數佛士之外 (意思是，如果越過釋迦牟尼佛的佛土，再繼續往東行，仍要經過許多佛土)，你將到達一個名為東方淨琉璃世界的佛土。有上師貝卡則佛，即藥師佛，又稱為琉璃光佛，住在那裡教授佛法。佛陀告訴文殊師利，由於藥師佛在仍是菩薩尚未開悟時，曾發下十二大願，因此，憶念他的名號將獲得極大利益，向他祈請亦可得到強大的加持。事實上，一個人由於對藥師佛的虔誠信仰而獲得日益增長的利益，主要是根據當他還是菩薩時所發的誓願。
藥師佛所發十二大願中的第一大願是：「願我來世達到完全證悟而成佛時，我身體所放的明亮光芒，得以照耀無量無邊世界，使所有照及的眾生都獲得與我一般的佛身，具三十二大丈夫相、八十種隨形好。」
藥師佛在還是菩薩時許下的第二大願，仍與他的外表有關，那是：「願我未來達到完全證悟而成佛時，我的身體明亮燦爛如琉璃寶石，願它無瑕、光明、廣大、愉悅、榮耀、而極盡莊嚴，願所有看到它的人皆蒙利益。」
藥師佛在仍是菩薩時，許下的第三大願是：「願在他證悟成佛時，以無量智慧與方便，帶給一切眾生豐足繁榮。」
藥師佛的第四大願是：「願他能解救走入邪道的人，並使之步上得解脫的菩提正道。」第四大願第二部分是：「願走在只求自身解脫道上的眾生，改行帶領眾生皆得解脫的大乘之道。」
藥師佛的第五大願是：「願成佛之後，可啟發一切眾生的美德善行。」
第六大願是針對具有先天的身體殘障者所發的願。藥師佛「願以他的加持力治癒所有先天身體上有缺陷的眾生，諸如視聽障、肢體殘缺或患毒性疾病者。」
藥師佛的第七大願是：「願那些無助、無友、也無資源，卻生了重病的人，只要聽到他的名號，他們的貧病之苦即可消除；只要聽到或想到他的名號，或看到他的像，在那悲慘境遇中的眾生，便得以從疾病的痛苦和加重疾病的貧窮中解脫；此外，那些眾生一旦聽過藥師佛的名號，將在成佛之前的所有世都不再生病。」
藥師佛的第八大願是：「在這般境遇中的人，若看見藥師佛的像或聽到他的名號，會對他們的人性生出足夠的信心，對於自已與他們的歧視者是同等的人這項事實，會有足夠的認知與信心，而他們將逃脫受歧視的境況。」
所有這些宏大的誓願，都是藥師佛在發菩提心，開始步上成佛之道時所立下的。《藥師佛經》解釋這十二大願，使我們了解如何得到藥師佛身、語、意的加持，以及對我們有什麼意義，釋迦牟尼佛教授此經的目的是，激勵我們精進修行。在此所傳達的概念是，觀想藥師佛，向藥師佛祈請，持藥師佛名號，將帶給我們不尋常的利益。對此有所了解後，將激起你修習藥師佛法的熱誠，這份熱誠會驅使你修藥師佛法，並且因而使您一定能獲得修法的成果。
藥師佛的第九大願是：「願使一切眾生解脫魔羅的羅網或套索。」魔羅的套索指的是我們解脫的障礙。在這裡的意思是，指任何足以使你步入歧途的不正確見解，任何帶你偏離解脫而非趨向解脫的見解。
藥師佛的第十大願是：「願眾生得以解脫統治者對他們的迫害。」意思是透過藥師佛的加持，可以保護眾生免於暴虐的君王加諸於人民的牢獄、死刑，以及所有其他苦難與殘酷。
第十一大願與第十二大願有共同之處，它們都與解除眾生的貧窮之苦有關。第十一大願特別為解除眾生因缺乏生活所需而受的苦，諸如飢渴之苦，以及需不斷為維生而掙扎之苦。藥師佛此一大願是：「要解除眾生食物及飲料的短缺，並使不必為求溫飽而備嘗艱辛，由此引伸，也要使一切眾生得享佛陀所稱的法的美味。」這表示，藥師佛不僅為眾生帶來身體上的解脫，給予身體滋養，同時也賜予法教的精神滋養。
藥師佛的第十二大願是集中在真正的貧窮，特別是缺少使我們生活舒適的事物上。首先，藥師佛發願提供衣服，給那些因衣著不足而受寒、熱等苦的眾生。此外，他還發願提供寶飾品，像珠寶之類的飾物，給沒有這些東西的人。與此性質相似的，他也發願提供樂器給沒有樂器的人，使他們的生活中增添美妙的樂音。此願著重在滿足眾生的願望，給他們想要的東西，使他們得到短時間的樂。
釋迦牟尼佛在《藥師佛經》中宣布了藥師佛初發菩提心時所立的十二大願。之後，佛陀繼續對文殊師利說話，因為是他向佛陀提問的，佛陀指出由於藥師佛發願的結果，他自身及他的佛土之功德莊嚴是無限量的。釋迦牟尼佛也提到，藥師佛在他的佛土有日光普照菩薩與月光普照菩薩兩位主要協侍。佛陀繼續於文殊師利說：「具有信心且精進而有慧見的男女，應祈請藥師佛，禪修藥師佛，並持藥師佛名號。」
釋迦牟尼佛在《藥師佛經》中宣布了藥師佛初發菩提心時所立的十二大願。之後，佛陀繼續對文殊師利說話，因為是他向佛陀提問的，佛陀指出由於藥師佛發願的結果，他自身及他的佛土之功德莊嚴是無限量的。釋迦牟尼佛也提到，藥師佛在他的佛土有日光普照菩薩與月光普照菩薩兩位主要協侍。佛陀繼續於文殊師利說：「具有信心且精進而有慧見的男女，應祈請藥師佛，禪修藥師佛，並持藥師佛名號。」
接著，佛陀講到祈請藥師佛的其他利益。佛說有些人非常貪財，什麼都捨不得給出去，他指出這些人之所以如此，是因為基本上他們不了解布施的利益。這種缺乏了解，使他們執著於緊抓住自己的財產不放，而從來沒想到要布施。如果因情況所逼不得不給出什麼，那會使他們極端痛苦，即使是給自己的家人也難免如此。問題在於，如果你如此貪財，將來很可能會有不幸的來生。佛說，像這樣貪婪的人，如果能夠聽到藥師佛的名號，並且與他結上某種緣---基本上是表示得知藥師佛的德性，將會使他得到啟發而了解布施的價值。當他們明白布施的價值之後，他們會變得很慷概，而因此就不會投生惡道；並且在他們所有的來生當中，這種布施的動力都會存在，不但使他們一直樂善好施，並具還會鼓勵別人也做慷慨的人。
這是經中所解釋的持藥師佛名號的第一種利益。至於第二種利益，佛又對文殊菩薩說，同樣地，有些人一向行為不端，他們不把道德當一回事，認為道德是沒有意義的，他們之所以如此，是因為不了解道德的價值，他們不了解依道德行事的利益，也不了解不道德的行為會導致怎樣的後果。同時，他們對於佛法或任何靈性方的追求也毫無興趣，也因為不了解其價值，既然不知其有何價值，自然也不會產生興趣。不過，即使心態如此極端的人，如果聽到藥師佛的名號，也會使他們由開始尊重，逐漸對道德與佛法的修持發生興趣。因此，他們會端正行為，並且研及修持佛法，這使他們不但今生幸福，並且有愈來愈美好幸福的許多來生。對端正他們的行為、研習及修持佛法的動力，將會持續，並與時俱增。
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